Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNDC1Q96C34 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms