Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms