Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms