Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF3AQ92664 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms