Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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CNNM3Q8NE01 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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CNNM3Q8NE01 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CNNM3Q8NE01 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNNM3Q8NE01 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNNM3Q8NE01 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNNM3Q8NE01 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNNM3Q8NE01 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNNM3Q8NE01 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNNM3Q8NE01 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNNM3Q8NE01 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CNNM3Q8NE01 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
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