Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ZNF439Q8NDP4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ZNF439Q8NDP4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ZNF439Q8NDP4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ZNF439Q8NDP4 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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ZNF439Q8NDP4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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ZNF439Q8NDP4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF439Q8NDP4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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