Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF1Q8N6C5 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms