Protein–RNA interactions for Protein: Q86X40

LRRC28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC28Q86X40 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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