Protein–RNA interactions for Protein: Q86WI1

PKHD1L1, Fibrocystin-L, humanhuman

Predictions only

Length 4,243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1L1Q86WI1 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1L1Q86WI1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1L1Q86WI1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1L1Q86WI1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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