Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMB4Q86W47 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms