Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HAPLN4Q86UW8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms