Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
USP53Q70EK8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP53Q70EK8 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP53Q70EK8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP53Q70EK8 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
USP53Q70EK8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP53Q70EK8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP53Q70EK8 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP53Q70EK8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP53Q70EK8 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP53Q70EK8 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP53Q70EK8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP53Q70EK8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP53Q70EK8 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
USP53Q70EK8 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP53Q70EK8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP53Q70EK8 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP53Q70EK8 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP53Q70EK8 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP53Q70EK8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP53Q70EK8 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP53Q70EK8 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP53Q70EK8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
USP53Q70EK8 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP53Q70EK8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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