Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms