Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LMBR1LQ6UX01 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMBR1LQ6UX01 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms