Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms