Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
C9orf84Q5VXU9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C9orf84Q5VXU9 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms