Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD4Q5VX71 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms