Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM46CQ5VWP2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms