Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF20Q5VTR2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF20Q5VTR2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RNF20Q5VTR2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF20Q5VTR2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms