Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYCP2LQ5T4T6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms