Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATAD3CQ5T2N8 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms