Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ODF2Q5BJF6 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms