Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SDK2Q58EX2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms