Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms