Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ISXQ2M1V0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms