Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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