Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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NDUFA9Q16795 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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NDUFA9Q16795 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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NDUFA9Q16795 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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NDUFA9Q16795 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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NDUFA9Q16795 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
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NDUFA9Q16795 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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NDUFA9Q16795 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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NDUFA9Q16795 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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NDUFA9Q16795 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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NDUFA9Q16795 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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NDUFA9Q16795 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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NDUFA9Q16795 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDUFA9Q16795 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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