Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LAMA3Q16787 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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