Protein–RNA interactions for Protein: Q16663

CCL15, C-C motif chemokine 15, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL15Q16663 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCL15Q16663 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCL15Q16663 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL15Q16663 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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