Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK7Q16549 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms