Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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RPE65Q16518 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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