Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GRIK5Q16478 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GRIK5Q16478 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GRIK5Q16478 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GRIK5Q16478 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.33■■□□□ 1
GRIK5Q16478 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK5Q16478 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK5Q16478 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GRIK5Q16478 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK5Q16478 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK5Q16478 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK5Q16478 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GRIK5Q16478 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK5Q16478 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK5Q16478 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK5Q16478 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK5Q16478 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK5Q16478 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK5Q16478 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK5Q16478 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
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