Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZFHX3Q15911 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms