Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF11Q15544 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF11Q15544 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms