Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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SEC23BQ15437 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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SEC23BQ15437 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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SEC23BQ15437 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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SEC23BQ15437 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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SEC23BQ15437 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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SEC23BQ15437 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
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SEC23BQ15437 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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SEC23BQ15437 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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SEC23BQ15437 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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SEC23BQ15437 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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SEC23BQ15437 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEC23BQ15437 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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