Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRRQ15256 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRRQ15256 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms