Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

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Length 2,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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PCM1Q15154 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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PCM1Q15154 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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PCM1Q15154 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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