Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
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