Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCARF1Q14162 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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