Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VGLL4Q14135 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms