Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE1CQ14123 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE1CQ14123 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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