Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX2Q13950 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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