Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA9Q13797 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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