Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SHROOM2Q13796 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
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SHROOM2Q13796 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
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