Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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TUBA3CQ13748 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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TUBA3CQ13748 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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TUBA3CQ13748 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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TUBA3CQ13748 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA3CQ13748 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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