Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEUROD1Q13562 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms