Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGB3BPQ13352 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms