Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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SGCGQ13326 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCGQ13326 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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