Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms