Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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SEMA3BQ13214 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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SEMA3BQ13214 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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SEMA3BQ13214 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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SEMA3BQ13214 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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SEMA3BQ13214 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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SEMA3BQ13214 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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SEMA3BQ13214 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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SEMA3BQ13214 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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SEMA3BQ13214 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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SEMA3BQ13214 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
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